≪分類≫ Domain(ドメイン)＞Kingdom(界)＞Division(門)＞Class(綱)＞Order(目)＞Family(科)＞Tribe(族・連)＞Genus(属)＞Species(種)＞Subspecies(亜種)

[A]

• Acetobacter　
• Acetobacter aceti　
• Acetobacter pasteurianus　
• Acidaminococcus　アシダミノコッカス属　嫌気性/グラム陰性/球菌
• Acinetobacter　アシネトバクター属　ナイセリア科; 好気性/グラム陰性/桿菌
• Acinetobacter baumannii　
• Acinetobacter calcoaceticus　
• Acinetobacter lwoffii　
• Actinobacillus　アクチノバチルス属　ブルセラ科; 好気性/グラム陰性/桿菌
• Actinobacillus actinomycetemcomitans　
• Actinomadura　
• Actinomadura madurae　
• Actinomadura pelletieri　
• Actinomycetaceae　放線菌科
• Actinomyces　アクチノミセス属
• Actinomyces bovis
• Actinomyces israelii
• Actinomyces naeslundii
• Actinomyces odontolyticus
• Actinomyces viscosus　
• Aeromonas　
• Aeromonas sorbria　
• Aeronococcus　
• Alcaligenes　アルカリゲネス属　不明科; 偏性好気性/グラム陰性/桿菌･球桿菌･球菌
• Alcaligenes faecalis　アルカリ大便菌　
• Anaerobiospirillum succiniciproducens　
• Anaerobiospirillum thomasii　
• Aspergillus　
• Aspergillus fumigatus　
• Aspergillus nidulans
• Aspergillus niger

  [B]

• Bacillaceae　バシラス科
• Bacillus　バシラス属　バシラス科; 通性嫌気性(好気性)/グラム陽性/桿菌
• Bacillus anthracis　炭疽菌
• Bacillus brevis
• Bacillus cereus　セレウス菌　食中毒
• Bacillus polymyxa　
• Bacillus safensis　
• Bacillus stearothermophilus　
• Bacillus subtilis　枯草菌　Bacitracin
• Bacillus thuringiensis　昆虫病原性細菌
• Bacteroides　バクテロイデス属　嫌気性/グラム陰性/桿菌
• Bartonella bacilliformis　
• Bifidobacterium　ビフィドバクテリウム属　嫌気性/グラム陽性/桿菌
• Bifidobacterium bifidum　ビフィズス菌
• Blastomyces dermatitidis　
• Bordetella　ボルデテラ属　不明科; グラム陰性/桿菌
• Bordetella bronchiseptica　
• Bordetella parapertussis　
• Bordetella pertussis　百日咳菌　
• Borrelia　ボレリア属　スピロヘータ目、スピロヘータ科
• Borrelia burgdorferi　
• Brevibacterium　
• Brevibacterium flavum　
• Brevundimonas diminuta　
• Brucella　ブルセラ属　不明科; 非運動性/芽胞性/好気性/グラム陰性/桿菌
• Brucella abortus　
• Brucella canis　
• Brucella melitensis　ブルセラ症(brucellosis)　
• Brucella ovis　
• Brucella suis
• Burkholderia mallei　
• Burkholderia pseudomallei　

  [C]

• Calymmatobacterium　
• Calymmatobacterium granulomatis　
• Campylobacter　
• Campylobacter coli　
• Campylobacter fetus　
• Campylobacter jejuni　
• Candida　カンジダ属　'クリプトコックス科'Cryptococcaceae、'モニリア目'Moniliales; 不完全菌である真菌
• Candida albicans　日和見感染・菌交代症である鵞口瘡の原因菌
• Chlamydiales　クラミジア目
• Chlamydiaceae　クラミジア科
• Chlamydia　クラミジア属
• Chlamydia psittaci
• Chlamydia trachomatis
• Chlamydia pneumoniae
• Chlamydia pecorum
• Citrobacter　シトロバクター属　腸内細菌科; 通性嫌気性/グラム陰性/桿菌
• Clostridium　クロストリジウム属　`バチルス科`Bacillaceae; 嫌気性/グラム陽性/桿菌
• Clostridium botulinum　ボツリヌス菌
• Clostridium difficile　ディフィシル菌
• Clostridium novyi　ノーヴィ菌　ガス壊疽
• Clostridium perfringens　ウェルシュ菌　ガス壊疽; 食中毒
• Clostridium tetani　破傷風菌
• Clostridium welchii　ウェルシュ菌　(=perfringens)
• Coccidioides　コクシジオイド属　真菌
• Coccidioides immitis　コクシジオイド症
• Corynebacterium　
• Corynebacterium bovis　
• Corynebacterium diphtheriae　
• Corynebacterium equi　
• Corynebacterium ulcerans　
• Coxiella　
• Coxiella burnetii　
• Cristispira　クリスチスピラ属　スピロヘータ科、スピロヘータ目
• Cryptococcaceae　クリプトコックス科　'モニリア目'Moniliales; Candida albicansが入っている
• Cryptococcus　
• Cryptococcus neoformans　

  [D]

  [E]

• Eikenella corrodens　
• Entamoeba gingivalis　歯肉アメーバ
• Entamoeba histolytica　赤痢アメーバ　原虫
• Enterobacteriaceae　腸内細菌科　通性嫌気性/グラム陰性/桿菌
• Enterobacter　腸内細菌属　腸内細菌科; 好気性/グラム陰性/桿菌
• Enterobacter aerogenes
• Enterobacter cloacae
• Enterobacter agglomerans
• Enterococcus　腸球菌属　
• Enterococcus faecalis　腸球菌
• Escherichia　エシェリキア属
• Escherichia coli　大腸菌　腸内細菌科
• Eubacterium　ユウバクテリウム属　嫌気性/グラム陽性/桿菌
• Erysipelothrix　
• Erysipelothrix rhusiopathiae　
• Exophiala　
• Exophiala dermatitidis　

  [F]

• Flavobacterium　フラボバクテリウム属　不明科; 非運動性/好気性/グラム陰性/桿菌
• Fonsecaea　
• Fonsecaea pedrosai　
• Francisella　フランシセラ属　不明科; 非運動性/偏性好気性/グラム陰性/桿菌; 野兎病(tularemia)
• Francisella tularensis　野兎病(tularemia)
• Fusobacterium　フソバクテリウム属　バクテロイデス科; 嫌気性/グラム陰性/桿菌; 化膿性感染症
• Fusobacterium nucleatum　

  [G]

  [H]

• Haemophilus　ヘモフィルス属　グラム陰性/桿菌
• Haemophilus ducreyi　軟性下疳菌　性感染症のchancroid`軟性下疳`の原因菌
• Haemophilus influenzae　インフルエンザ菌　呼吸器感染症、結膜炎、髄膜炎を引起す
• Hafnia　ハフニア属　腸内細菌科
• Haloarcula marismortui　
• Haloferax denitrificans　
• Haloferax mediterranei
• Haloferax volcanii　
• Helicobacter 　
• Helicobacter pylori　
• Histoplasma 　
• Histoplasma capsulatum　
• Histoplasma duboisii　
• Histoplasma farciminosum　

  [I]

• Ixodes pacificus　
• Ixodes persulcatus　
• Ixodes ricinus　
• Ixodes scapularis　

  [J]

  [K]

• Klebsiella　
• Klebsiella oxytoca　
• Klebsiella pneumoniae　肺炎桿菌

  [L]

• Lactobacillus　ラクトバシラス属　嫌気性/グラム陽性/桿菌
• Lactobacillus acidophilus　
• Lactococcus　
• Legionellaceae　レジオネラ科　
• Legionella　レジオネラ属　レジオネラ科; 好気性/グラム陰性/桿菌
• Legionella pneumophila　レジオネラ・ニューモフィラ　肺炎の在郷軍人病を引起す
• Leptonema　レプトネマ属　スピロヘータ目; レプトスピラ科
• Leptospiraceae　レプトスピラ科　スピロヘータ目
• Leptospira　レプトスピラ属　スピロヘータ目、レプトスピラ科
• Leptospira biflexa　
• Leptospira interrogans　
• Leptotrichia　レプトトリキア属　嫌気性/グラム陰性/桿菌
• Listeria　
• Listeria monocytogenes

  [M]

• Megasphaera　メガスフェラ属　嫌気性/グラム陰性/球菌
• Methicilin-resistant Staphylococcus aureus　メチシリン耐性の黄色ブドウ球菌　
• Micrococcaceae　ミクロコッカス科
• Micrococcus　ミクロコッカス属
• Mollicutes　Mollicutes綱
• Moniliales　モニリア目　Candida albicansが入っている
• Moraxella　モラキセラ属　ナイセリア科; 非運動性・好気性/グラム陰性球桿菌
• Mycobacteriaceae　マイコバクテリア科
• Mycobacterium　マイコバクテリウム属　好酸性の好気性細菌; 結核菌・癩菌など　
• Mycobacterium avium
• Mycobacterium bovis　
• Mycobacterium chelonae
• Mycobacterium fortuitum
• Mycobacterium gordonae
• Mycobacterium haemophillum　
• Mycobacterium intracellulare　
• Mycobacterium kansasii　
• Mycobacterium leprae　癩菌
• Mycobacterium malmmoense　
• Mycobacterium marinum
• Mycobacterium nonchromogenicum
• Mycobacterium scrofulaceum
• Mycobacterium simiae　
• Mycobacterium szulgai　
• Mycobacterium thermoresistibile
• Mycobacterium tuberculosis　結核菌
• Mycobacterium ulcerans　
• Mycobacterium xenopi　
• Mycoplasmatales　マイコプラズマ目　Mollicutes綱
• Mycoplasmataceae　マイコプラズマ科
• Mycoplasma　マイコプラズマ属
• Mycoplasma mycoides　
• Mycoplasma pneumoniae　

  [N]

• Neisseriaceae　ナイセリア科
• Neisseria　ナイセリア属　ナイセリア科; グラム陰性双球菌
• Neisseria gonorrhoeae　淋菌
• Neisseria lactamica　喉の常在菌; 時に髄膜炎を引き起こす
• Neisseria meningitidis　髄膜炎菌
• Nocardia　ノカルジア属
• Nocardia asteroides　
• Nocardia brasiliensis
• Nocardia farcinica　
• Nocardia otitidiscaviarum　

  [O]

  [P]

• Paracoccus denitrificans　
• Pasteurellaceae　パスツレラ科　通性嫌気性/グラム陰性/桿菌
• Pasteurella　
• Pasteurella haemolytica　
• Pasteurella multocida　
• Pasteurella pneumotropica　
• Pasteurella tularensis　
• Pasteurella ureae　
• Pediococcus　
• Penicillium　
• Penicillium chrysogenum
• Penicillium marneffei　
• Penicillium notatum　penicillinの原料
• Peptococcus　ペプトコッカス属　嫌気性/グラム陽性球菌
• Peptostreptococcus　ペプトストレプトコッカス属　嫌気性/グラム陽性球菌
• Picornaviridae　ピコルナウイルス科
• Plasmodiidae　プラスモディウム科
• Plasmodium　マラリア原虫
• Plasmodium vivax
• Plasmodium malariae
• Plasmodium falciparum
• Plasmodium ovale
• Pneumocystis carinii　ニューモシスチス・カリニ　原虫; 日和見感染でAIDSの末期に肺炎を引起す
• Poliovirus　ポリオウイルス　ピコルナウイルス科
• Porphyromonas　
• Porphyromonas asaccharolytica
• Porphyromonas cangingivalis
• Porphyromonas canoris
• Porphyromonas cansulci
• Porphyromonas catoniae
• Porphyromonas circumdentaria
• Porphyromonas crevioricanis
• Porphyromonas endodontalis
• Porphyromonas gingivalis　
• Porphyromonas gingivicanis
• Porphyromonas gulae
• Porphyromonas levii
• Porphyromonas macacae
• Porphyromonas salivosa　(=Porphyromonas macacae)
• Propionibacterium　プロピオニバクテリウム属　嫌気性/グラム陽性/桿菌
• Prevotella intermedia　
• Proteus　プロテウス属　腸内細菌科
• Proteus mirabilis　プロテウス・ミラビリス
• Proteus vulgaris　プロテウス・ブルガリス
• Pseudomonadaceae　シュードモナス科
• Pseudomonas　シュードモナス属
• Pseudomonas aeruginosa　緑膿菌　極鞭毛をもつ運動性・無芽胞性・好気性/グラム陰性/桿菌
• Pseudomonas cepacia　セパシア菌
• Pseudomonas denitrificans　
• Pseudomonas fluorescens　フルオレッセンス菌
• Pseudomonas pseudomallei　
• Pseudomonas putida　プチダ菌
• Pseudomonas stuzeri　
• Pyrobaculum aerophilum　
• Pyrobaculum islandicum　

  [Q]

  [R]

• Reoviridae　レオウイルス科　"ウイルス"
• Rhinosporidiosis　
• Rhinosporidiosis seeberi　
• Rhodococcus 　
• Rhodococcus equi　
• Rickettsiales　リケッチア目
• Rickettsiaceae　リケッチア科
• Rickettsia　リケッチア属
• Rickettsia akari　
• Rickettsia australis　
• Rickettsia canada　
• Rickettsia conorii　
• Rickettsia japonica　
• Rickettsia montana　
• Rickettsia parkeri　
• Rickettsia prowazekii　
• Rickettsia rhipicephali　
• Rickettsia rickettsii　
• Rickettsia sibirica　
• Rickettsia typhi　
• Rochalimaea　
• Rochalimaea quintan　
• Rochalimaea vinsonii　

  [S]

• Salmonella　サルモネラ属　腸内細菌科; 通性嫌気性/グラム陰性/桿菌; 食中毒
• Salmonella enterica
• Salmonella paratyphi A　
• Salmonella typhi　
• Serratia　セラチア属　腸内細菌科; 通性嫌気性/グラム陰性/桿菌; 赤色色素を生成
• Serratia liquefaciens　
• Serratia marcescens　霊菌　ヒト日和見感染の病原菌
• Serratia rubidaea　
• Shigella 　
• Spirillum　スピリウム属　らせん菌科; グラム陰性
• Spirillum minus　スピリウム・ミヌス　鼠咬病の病原体
• Spirochaetales　スピロヘータ目
• Spirochaetaceae　スピロヘータ科
• Spirochaeta　スピロヘータ属 スピロヘータ科
• Sporothrix 　
• Sporothrix schenckii　
• Sporotrichum　スポロトリクム属 グラム陰性/桿菌
• Sporotrichum carnis　
• Staphylococcus　スタヒロコッカス属
• Staphylococcus aureus　黄色ブドウ球菌
• Staphylococcus epidermidis　表皮ブドウ球菌
• Streptobacillus　
• Streptobacillus monilliformis　
• Streptococcaceae　ストレプトコッカス科、連鎖球菌科
• Streptococcus　ストレプトコッカス属、連鎖球菌属
• Streptococcus agalactiae　アガラクチア菌、Ｂ群連鎖球菌
• Streptococcus equi　
• Streptococcus gordonii　
• Streptococcus mutans　ミュータンス連鎖球菌
• Streptococcus pneumoniae　肺炎連鎖球菌
• Streptococcus pyogenes　化膿連鎖球菌
• Streptococcus salivarius　
• Streptococcus sanguis　
• Streptococcus sobrinus
• Streptococcus suis　豚に感染
• Streptomycetaceae　ストレプトマイセス科
• Streptomyces　ストレプトマイセス属
• Streptomyces erythreus　
• Streptomyces griseus　
• Streptomyces lincolnesis　
• Streptomyces mediterranei
• Streptomyces niveus　Novobiocin
• Streptomyces orientalis　Vancomycin
• Streptomyces venezuelae　

  [T]

• Toxoplasma　トキソプラスマ属　コクシジウム目
• Toxoplasma gondii　toxoplasmosis`トキソプラスマ症`を引起す
• Treponema　トレポネーマ属　スピロヘータ科
• Treponema carateum　
• Treponema pallidum　梅毒トレポネーマ　
• Treponema pertenue　
• Trichomonas tenax　口腔トリコモナス
• Trichomonas vaginalis　膣トリコモナス
• Trichophyton　白癬菌属
• Tropheryma whippelii　Whipple diseaseを引起す

  [U]

  [V]

• Veillonella　ベイヨネラ属　嫌気性/グラム陰性/球菌
• Vibrionaceae　ビブリオ科
• Vibrio　ビブリオ属　通性嫌気性/グラム陰性/桿菌
• Vibrio cholerae　
• Vibrio fluvialis　
• Vibrio mimicus　
• Vibrio parahaemolyticus　食中毒を引起す
• Viridans streptococc　緑色レンサ球菌

  [W]

  [X]

• Xanthomonas
• Xanthomonas maltophilia　マルトフィリア菌

  [Y]

• Yersinia　エルシニア属　腸内細菌科; 通性嫌気性/グラム陰性/桿菌
• Yersinia enterocolitica　エルシニア・エンテロコロチカ
• Yersinia pestis　ペスト菌
• Yersinia pseudotuberculosis　偽結核菌　

  [Z]

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  ≪ウイルス≫

• Coronaviridae　コロナウイルス科
• Coronavirus　コロナウイルス属　コロナウイルス科; ニワトリ伝染性気管支炎ウイルス; １本鎖ＲＮＡ、エンベロープあり

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  ≪寄生虫≫

• Acanthocheilonema perstans　filarial worm
• Anchylostoma braziliense
• Anchylostoma caninum
• Anchylostoma duodenale
• Ascaris lumbricoides　nematoda, roundworm (線虫)
• Brugia malayi　filarial worm
• Clonorchis sinensis　trematode, fluke (吸虫)
• Diphyllobothrium latum　cestode, tapeworm (条虫)
• Dipylidium caninum　cestode, tapeworm (条虫)
• Echinococcus granulosus　cestode; tapeworm (条虫)
• Enterobius vermicularis　pinworm; threadworm (蟯虫)
• Fasciolopsis buski　trematode; fluke (吸虫)
• Fasciola hepatica　trematode; fluke (吸虫)
• Heterophyes heterophyes　trematode; fluke (吸虫)
• Hymenolepis nana　cestode; tapeworm (条虫)
• Loa loa　filarial worm
• Mansonella ozzardi　filarial worm
• Metagonium yokogawai　trematode, fluke (吸虫)
• Necator americanus
• Onchocerca volvulus　filarial worm
• Paragonimus westermani　trematode, fluke (吸虫); 肺を侵襲
• Schistosoma haematobium　schistosome (住血吸虫)
• Schistosoma mansoni　schistosome (住血吸虫)
• Schistosoma japonicum　schistosome (住血吸虫)
• Strongyloides stercoralis
• Taenia solium　cestode, tapeworm (条虫)
• Taenia saginata　cestode, tapeworm (条虫)
• Trichuris trichiura
• Trichinella spiralis
• Wuchereria bancrofti　filarial worm

  (用語)

• 非運動性 (nonmobile)
• 好気性 (aerobic)